连锁门诊总经理的岗位职责主要包括：制定并实施门诊整体运营策略和规划，全面管理门诊的经营管理、服务与流程管控、员工培养等，监督门诊经营数据并提出优化方案，协调各部门沟通合作，确保日常工作正常开展，并持续改进门诊的经营效益。